Träning

Utbildningen introducerar FinnGen-forskningsprojektet och principerna samt den vetenskapliga planen för FinnGen. Den täcker FinnGen som organisation, tillgängligheten och strukturen av data, samt forskningsprojektets position både nationellt och internationellt. Deltagarna kommer att kunna förklara vad FinnGen-forskningsprojektet och data är. Utbildningen genomförs på distans via Zoom och är öppen för alla som är intresserade av FinnGen, utan krav på anknytning till Varha, UTU eller Auria. Registrering sker via Åbo universitets personalutbildningskalender (för UTU-personal) eller via registreringslänken (för UTU och andra). Registreringen öppnar en månad före evenemanget.

Språket är finska eller engelska.

Tidigare och kommande evenemang:
27.01.2025
25.08.2025
26.01.2026
31.08.2026
25.01.2027

Deltagarna i utbildningen kommer att kunna förklara vad FinnGens gröna data och gröna verktyg är och hur man använder dem i sin egen forskning. Deltagarna måste ha en anknytning till Varha, UTU eller Auria. Under utbildningen kan varje deltagare ansöka om FinnGen-användaruppgifter, vilket är kostnadsfritt. Utbildningen genomförs på distans via Zoom och varar 2+2 timmar: undervisning om de gröna data och verktygen (2 timmar) och verktygsdemonstrationer (2 timmar). Registrering för utbildningen sker via Åbo universitets personalutbildningskalender (för UTU-personal) eller via registreringslänkarna (för UTU, Varha, Auria). Registreringen öppnar två månader före evenemanget.

Språket är finska eller engelska.

Tidigare och kommande evenemang:
24.02.2025
29.09.2025
23.02.2026
28.09.2026
22.02.2027

Målet är att bekanta deltagarna med FinnGens sandlådemiljö och de röda data. Deltagarna kommer att kunna förklara vad de röda data består av och vad sandlådemiljön är, och de kommer att kunna ansöka om nödvändiga tillstånd för att analysera de röda data. Dessutom får deltagarna lära sig hur man utformar ett FinnGen-analysförslagsformulär för att publicera sina egna forskningsresultat. Deltagarna måste ha en anknytning till Varha, UTU eller Auria. Det rekommenderas också att deltagarna har FinnGen-användaruppgifter och sandlådebehörigheter i förväg, men dessa kan också erhållas under utbildningen. Utbildningen varar 2+2 timmar och genomförs på distans via Zoom. Två timmar ägnas åt undervisning om strukturen av de röda data och två timmar åt sandlådemiljön. Registrering för utbildningen sker via Åbo universitets personalutbildningskalender (för UTU-personal) eller via registreringslänkarna (för UTU, Varha, Auria). Registreringen öppnar tre månader före evenemanget.

Språket är finska eller engelska.

Tidigare och kommande evenemang:
24.03.2025
27.10.2025
30.03.2026
26.10.2026
29.03.2027

Målet med utbildningen är att lära ut användningen av de vanligaste verktygen i sandlådemiljön: Atlas, Cohort Operations Tool, Pipeline, Genotype Browser, PGS Browser. Dessutom kommer R, Python, SQL och UNIX programmeringsspråk att demonstreras för att analysera rådata, och källmaterial för självstudier av dessa programmeringsspråk kommer att tillhandahållas. Deltagarna kommer att kunna självständigt genomföra olika register- och genetiska studier i sandlådan, förstå katalogstrukturen för FinnGen-data, ladda ner resultat från sandlådan till sina egna datorer och publicera enligt FinnGens principer. Deltagarna måste ha en anknytning till Varha, UTU eller Auria. Dessutom krävs tillgång till FinnGen Red-data för att delta i övningarna. Ansökningsformuläret och instruktioner för tillgång till Red-data kommer att skickas till registrerade deltagare före utbildningen.

Utbildningen organiseras i ett hybridformat, både på plats och på distans, i Kallo MED D2083-klassrummet. Varaktigheten är 2 + 2 timmar (föreläsning + demonstrationer), vilket inkluderar övningar. Registrering för utbildningen sker via Åbo universitets personalutbildningskalender (för UTU-personal) eller via registreringslänkarna (för UTU, Varha, Auria). Registreringen öppnar tre månader före evenemanget.

Språket är finska eller engelska.

Tidigare och kommande evenemang:
28.04.2025
24.11.2025
27.04.2026
30.11.2026
26.04.2027