Kansallisella tasolla FinnGen toimii verkostona, jossa kunkin suomalaisen yhteistyökumppanin tutkijoita tuetaan paikallisesti osana tutkimushanketta. Turun yliopiston FinnGen-tukiprojekti ylläpitää Varsinais-Suomen piirin tutkijaverkostoa järjestämällä koulutuksia ja tarjoamalla konsultaatio- ja analyysitukea kaikille FinnGenistä kiinnostuneille kliinikoille ja tutkijoille. Ota yhteyttä FinnGen-tukeen lisätietojen saamiseksi.

Tuki

Turun yliopiston FinnGen-tukiprojekti tarjoaa neuvontaa, analyysitukea, ja koulutusta kaikille Varsinais-Suomen piirin kliinikoille ja tutkijoille FinnGen-hankkeeseen liittyen. Tutkimushanke perustuu poikkeuksellisen laajaan ja avoimeen yhteistyöhön, joka yhdistää Turun yliopiston, Varsinais-Suomen hyvinvointialueen, Auria Biopankin, ja Turun yliopistollisen keskussairaalan. FinnGenin koko tietoaineisto on saatavilla tietoturvallisesti kaikille tutkijoille kaikissa näissä yhteistyöorganisaatioissa.

Voit ottaa meihin yhteyttä sivun lopussa olevalla yhteydenottolomakkeella tai lähettämällä sähköpostia osoitteeseen: finngen-support@utu.fi. Vastaamme muutaman arkipäivän kuluessa kaikkiin yhteydenottoihin.

Yhteyshenkilöt

Aleksi Kristian Winstén Tukikoordinaattori

FinnGen-tuki
Turun Yliopisto

Teemu Niiranen Vastuullinen johtaja

FinnGen-tuki
Turun yliopisto

Materiaalit

FinnGen-työkalut

FinnGen on sitoutunut avaamaan hankkeen tulokset vapaasti tutkimusyhteisön hyödynnettäväksi. Tuloksiin pääsee tutustumaan tarkoitusta varten luoduilla verkkosivuilla. Lisäksi tutkimustyössä kehittyneet työkalut ja muu materiaali on vapaasti saatavilla FinnGenin GitHub-sivustolla. Esimerkiksi FinnGenin LongitudinalDummyDataGenerator on R-paketti, jolla voi simuloida FinnGen-tietoaineiston, siten että simuloidun datan ominaisuudet ovat tilastollisesti samat kuin alkuperäisellä aineistolla.


Geenidatan yhteenvetotulokset

Terveysdatan yhteenvetotulokset

FinnGen Longitudinal DummyDataGenerator

FinnGen GitHub-sivusto

FinnGen handbook

FinnGenin datanvisualisointityökalut

MMP (Multiple Manhattan Plot)

Sairauspäätepisteiden selain

LAVAA

React app (Network explorer)

LD-selain

Kanta-laboratoriotulosten yhteenveto


Seuraavat työkalut edellyttävät kirjautumista FinnGen-käyttäjätunnuksella, jonka saa HelpDeskiltä: finngen-support@utu.fi

Varianttien annotointityökalu

FinnGen-portaali

CustomGWAS tulokset

Vihreäkirjasto

UKBB-metatulokset

Sukupuolierojen GWAS

Varianttiselain

Lääke-GWAS

 

Koulutusmateriaalit

FinnGen-käyttäjätunnukset

FinnGen-aineistoon voi hakea käyttöoikeutta, jos on affiliaatio Turun yliopistoon, Varsinais-Suomen hyvinvointialueeseen, tai Auria Biopankkiin. Käyttöoikeuksia haetaan suoraan FinnGeniltä ja hakulomakkeen saa tukikoordinaattorilta tai ottamalla yhteyttä FinnGen-tukeen. Yhteyttä voi ottaa alla olevalla yhteydenottolomakkeella tai lähettämällä s-postia osoitteeseen finngen-support@utu.fi.

Yhteydenottolomake

Please enable JavaScript in your browser to complete this form.
Nimi