Books and book chapters


Zuquim, G., Chaves, P.P., Sääksjärvi, I. & Tuomisto, H. 2021. Amazonia at the heart of the global ecological crisis. Pp. 152–165 in S. Garcia Ferrari, H. Egil Offerdal, & M. Alicja Kania (Eds.), Why Latin America Matters – A Collection of Essays. Edinburgh: Centre for Contemporary Latin American Studies.


Tuomisto, H. (2018) Different ways of defining diversity, and how to apply them in montane systems. In Hoorn, C., Perrigo, A.L. & Antonelli, A. (Eds.), Mountains, climate, and biodiversity. Pp. 295-308​. John Wiley & Sons Ltd. ISBN: 978-1-119-15987-2​​


Kalliola, R. & Mäki, S. (2017) Geographical Context of Western Amazonian Forest Use. In Myster R. W.  (ed.) Forest structure, functions and dynamics in Western Amazonia. John Wiley & Sons Ltd. pp. 53-84.

Tuomisto, H. Defining, Measuring, and Partitioning Species Diversity​. In: Reference Module in Life Sciences. (2017). Elsevier​. doi: 10.1016/B978-0-12-809633-8.02377-3


Van doninck, J. & Tuomisto, H. (2015) BRDF correction for Landsat TM/ETM+ data over Amazonian forests. Proceedings of the 2nd EARSeL International Workshop on Temporal Analysis of Satellite Images, 17.–19.6.2015, Stockholm, Sweden, pp. 349-354.


Salo, M., Sirén, A. Kalliola, R. (2014) Diagnosing Wild Species Harvest: Resource Use and Conservation. San Diego, CA: Elsevier Academic Press, 480 pp. [Sciencedirect] [Elsevier store]


Tuomisto, H. (2013) Defining, measuring, and partitioning species diversity. Encyclopedia of Biodiversity, 2nd edition. Elsevier. Pp. 434–446.

Sirén A. H., Montufar R. & Gualinga J. (2013) Palma de wayuri. (The wayuri palm) Pp. 135-144 in: Valencia R., Montúfar R., Navarrete H. & Balslev H. (eds.), Palmas Ecuatorianas: biología y usos sostenible. (Ecuadorian Palms: Biology and Sustainable Use. Publicaciones del Herbario de la Pontificia Universidad Católica del Ecuador, Quito, Ecuador. [PDF]


Zuquim, G., Costa, F.R.C., Prado, J. & Tuomisto, H. (2012) Guia de samambaias e licófitas da Rebio Uatumã, Amazônia central. Guide to the ferns and lycophytes of Rebio Uatumã, Central Amazonia. 2nd ed. Attema Design Editorial, Manaus, Brazil. 315 pp.


Lehtonen, S. & Falck, D. (2011) Watery varieties: aquarium plant diversity from aesthetic, commercial, and systematic perspectives. In: Aquino, J.C. (ed.), Ornamental Plants: Types, Cultivation and Nutrition. Nova Science Publishers, pp. 1-46.

Sirén, A. (2011). El consumo de pescado y fauna acuática silvestre en la Amazonía Ecuatoriana. (The consumption of fish and aquatic fauna in Ecuadorian Amazonia) COPESCAL Documento Ocasional 12. FAO


Hoorn, C., Wesselingh, F.P., Hovikoski, J. & Guerrero, J. (2010) The development of the Amazonian mega-wetland (Miocene; Brazil, Colombia, Peru, Bolivia). In Hoorn C. & Wesselingh, F.P. (eds), Amazonia: Landscape and species evolution. A look into the past. Wiley-Blackwell, pp. 123-142. [Wiley]

Hovikoski, J., Wesselingh, F.P., Räsänen, M., Gingras, M. & Vonhof, H.B. (2010) Marine influence in Amazonia: evidence from the geological record. In Hoorn C. & Wesselingh, F.P. (eds), Amazonia: Landscape and species evolution. A look into the past. Wiley-Blackwell, pp. 143-161. [Wiley]

Irion, G. & Kalliola, R. (2010) Long-term landscape development processes in Amazonia. In Hoorn, C. & Wesselingh, F. (eds), Amazonia: Landscape and species evolution. A look into the past. Wiley-Blackwell, pp. 185-197. [Wiley]


Zuquim, G., Costa, F.R.C., Prado, J. & Tuomisto, H. (2008) Guia de samambaias e licófitas da Rebio Uatumã, Amazônia central. Guide to the ferns and lycophytes of Rebio Uatumã, Central Amazonia. Attema Design Editorial, Manaus, Brazil. 316 pp.  [More info] [PDF (20.4 MB)]


Juvonen, S-K. & Sääksjärvi, I.E. (2005) Definition of methodologies linking taxonomic, collection and specimen databases with observational databases. UTU-LCC Publication 9: 51-55. Laboratory of Computer Cartography, University of Turku, Finland.

Ruokolainen, K. Tuomisto, H. & Kalliola, R. (2005) Landscape heterogeneity and species diversity in Amazonia. In: Bermingham, E., Dick, C.W. & Moritz, C. (eds.), Tropical Rainforests: Past, Present & Future. The University of Chicago Press, Chicago, USA, pp. 251-270.

Vieno, M., Sarvala, M., Sääksjärvi, I.E. & Toivonen, T. (2005) Observations on observational data. Network of organizations, institutions and specialized groups that hold, analyse and present spatial, observation-based biodiversity data. UTU-LCC Publication 9: 5-13. Laboratory of Computer Cartography, University of Turku, Finland.


Rajaniemi, S., Tomppo, E., Ruokolainen, K. & Tuomisto, H. (2004) Estimating number of pteridophyte and Melastomataceae species from satellite images in Western Amazonian rain forests. In: Corona, P., Köhl, M. & Marchetti, M. (eds.), Advances in forest inventory for sustainable forest management and biodiversity monitoring. Kluwer Forestry Series Book 76: 57-64.


Salovaara, K., Bodmer, R., Recharte, M. & Reyes, C. (2003) Diversity and abundance of mammals. In: Pitman, N., Vriesendorp, C., Moskovits, D. (eds.), Peru: Yavari. Rapid Biological Inventories Report 11. Chicago, IL. The Field Museum.


Schulman, L. (2002). Nature conservation in Amazonia: the role of biological theory in reserve delimitation. (Conservación de la naturaleza en la Amazonía: El rol de la teoría biológica en la delimitación de las reservas.). — In: Bussmann, R. W. & Lange, S. (Eds.), Conservación de la biodiversidad en los Andes y la Amazonía, memorias del primer congreso de biodiversidad, 24 a 28 Setiembre de 2001, Cusco, Perú (Conservation of biodiversity in the Andes and the Amazon, Proceedings of the first international congress of biodiversity): 501¬508. Inka e.V., Munich, Germany. (CD-ROM publication).


Duivenvoorden, J., Balslev, H., Cavelier, J., Grández, C., Tuomisto, H. & Valencia, R. (eds.) (2001) Evaluación de recursos forestales no maderables en la Amazonía noroccidental. IBED, Universiteit van Amsterdam, Amsterdam. 486 pages + two separate maps. Including:
  • Tuomisto, H. & Ruokolainen, K.: Variación de los bosques naturales en las áreas piloto a lo largo de transectos y en imágenes de satélite. Pp. 63-96.
Kalliola, R. (2001). Bases científicas para el uso de la tierra en selvas amazónicas. In: Flores Paitán, S. (ed.) Amazonía: orientaciones para el desarrollo sostenible. Embajada de Finlandia, UNAP, Banco central de Reserva del Perú & PNUD, Lima. Pp. 35-39.


Duivenvoorden, J., Balslev, H., Cavelier, J., Grández, C., Tuomisto, H. & Valencia, R. (1999) Non-timber forest plant resource assessment in NW Amazonia. In Ros-Tonen, M.A.F. (ed.), Seminar proceedings ‘NTFP research in the Tropenbos programme: results and perspectives’, 28 January 1999. The Tropenbos Foundation, Wageningen, The Netherlands, pp. 81-93.

Kalliola, R., Jokinen, P. & Tuukki, E. (1999). Fluvial dynamics and sustainable development in upper Rio Amazonas, Peru. – In Padoch, C., Ayres, J.M., Pinedo-Vasquez, M. & Henderson, A. (eds): Varzea. Diversity, development, and conservation of Amazonia’s whitewater floodplains. Advances in Economic Botany 13: 271-282.

Mäki, S. Luonnonympäristön monimuotoisuus maankäytön suunnittelun perustana Amazonian länsiosissa. (1999). In Ahlqvist, T., Inkinen, T. & Tuhkanen, S. (eds.), Kohden väitöskirjaa / Towards doctoral dissertation. Publicationes Instituti Geographici Universitatis Turkuensis 161: 71-76.


Kalliola, R. & Flores Paitán, S. (eds.) (1998). Geoecología y desarrollo Amazónico: estudio integrado en la zona de Iquitos, Perú. Annales Universitatis Turkuensis Ser A II 114. 544 pages + separate map. Including:
  • Flores Paitán, S., Gómez Romero, E. & Kalliola, R.: Características generales de la zona de Iquitos. Pp. 17-32.
  • Räsänen, M., Linna, A., Irion, G., Rebata Hernani, L., Vargas Huamas, R. & Wesselingh, F.: Geología y geoformas de la zona de Iquitos. Pp. 59-137.
  • Paredes Arce, G., Kauffman, S. & Kalliola, R.: Suelos aluviales recientes de la zona Iquitos-Nauta. Pp. 231-251.
  • Ruokolainen, K. & Tuomisto, H.: Vegetación natural de la zona de Iquitos. Pp. 253-365.
  • Kalliola, R., Ruokolainen, K., Tuomisto, H., Linna, A. & Mäki, S.: Mapa geoecológico de la zona de Iquitos y variación ambiental. Pp. 443-457.
  • Linna, A., Irion, G., Kauffman, S., Wesselingh, F. & Kalliola, R.: Heterogeneidad edáfica de la zona de Iquitos: origen y comprensión de sus propiedades. Pp. 461-480.
  • Tuomisto, H. & Ruokolainen, K.: Uso de especies indicadoras para determinar características del bosque y de la tierra. Pp. 481-491.
  • Salo, J. & Torres Vásquez, J.: Potencialidad de uso del recurso biodiversidad en Loreto. Pp. 493-512.
Lundberg, J., Marshall, L.G., Guerrero, J., Horton, B., Malabarba, M.C. & Wesselingh, F. (1998). The Stage for Neotropical Fish Diversification: A History of Tropical South American Rivers. In: L.R. Malabarba, R.E.Reis, R.P.Vari, Z.M.S.Lucena & C.A.S.Lucena (eds.), Phylogeny and Classification of Neotropical Fishes. Porto Alegre, Edipurcrs, Brazil, pp. 13-48.


Kalliola, R., Tuomisto, H. & Ruokolainen, K. (1996). Areas importantes para la conservación de la selva baja peruana desde el punto de vista geoecológico. In: Rodriguez, L. O. (ed.), Diversidad biológica del Peru: Zonas prioritarias para su conservación. GTZ & INRENA, Lima. Pp. 127-132.

Poulsen, A. D. & Tuomisto, H. (1996). Small-scale to continental distribution patterns of neotropical pteridophytes: the role of edaphic preferences. Camus, J.M., Gibby, M. & Johns, R.J. (eds.), Pteridology in Perspective. Royal Botanical Gardens, Kew, pp. 551-561.

Ruokolainen, K. (1996). Ferns and Melastomataceae as indicators of phytogeographic pattern in Amazonia. In Guillaumet, J.-L., Belin, M. & Puig, H. (eds.), Phytogéographie Tropicale: Réalités et Perspectives. ORSTOM, Paris, pp. 323-343.

Ruokolainen, K. & Puhakka, M. (1996). Western Amazonian floodplains, a variable and dynamic environment. Harcourt, C.S. & Sayer, J.A. (eds.), The conservation atlas of tropical forests: The Americas. Simon & Schuster, New York. p. 21.

Tuomisto, H. (1996). Habitat diversity and the distribution of species in the rain forests of Peruvian Amazonia. In Guillaumet, J.-L., Belin, M. & Puig, H. (eds.), Phytogéographie Tropicale: Réalités et Perspectives. ORSTOM, Paris, pp. 345-352. [PDF]


Kalliola, R., Puhakka, M. & Danjoy, W. (eds.) (1993). Amazonia peruana. Vegetación húmeda tropical en el llano subandino. PAUT & ONERN, Jyväskylä. 265 pages + separate map. Including:
  • Kalliola, R. & Puhakka, M.: Geografía de la selva baja peruana. Pp. 9-21.
  • Linna, A.: Factores que contribuyen a las caracteristicas del sedimento superficial en la selva baja de la Amazonia peruana. Pp. 87-97.
  • PAUT (Proyecto Amazonia de la Universidad de Turku): Mapa geoecológico de selva baja de la Amazonia Peruana. Map printed in Karttakeskus, Helsinki.
  • Puhakka, M. & Kalliola, R.: La vegetación en áreas de inundación en la selva baja de la Amazonia peruana. Pp. 113-138.
  • Puhakka, M., Kalliola, R., Salo, J. & Rajasilta, M. La sucesión forestal que sigue a la migración de ríos en la selva baja peruana. Pp. 167-201.
  • Ruokolainen, K. & Tuomisto, H. La vegetación de terrenos no inundables (tierra firme) en la selva baja de la Amazonia peruana. Pp. 139-153.
  • Räsänen, M. La geohistoria y geología de la Amazonia peruana. Pp. 43-67.
  • Räsänen, M., Kalliola, R. & Puhakka, M. Mapa geoecológico de la selva baja peruana: explicaciónes. Pp. 207-216.
  • Salo, J. Notas en la historia de la exploración científica y teorías en la selva baja de la Amazonia peruana. Pp. 24-31.
  • Salo, J. & Kalliola, R. Necesidades para el futuro en la selva baja peruana: Conservación e investigación cientifica. Pp. 235-249.
  • Tuomisto, H. Clasificación de vegetación en la selva baja peruana. Pp. 103-112.


Salo, J.S., & Kalliola, R.J. (1991). River dynamics and natural forest regeneration in the Peruvian Amazon. In Gómez-Pompa, A., Whitmore, T. C. & Hadley, M. (eds.) Rain forest regeneration and management. UNESCO MAB (Series) 6: 245-256.


Salo, J. & Räsänen, M. (1989). Hierarchy of Landscape Patterns in Western Amazon. Holm-Nielsen, L. B., Nielsen, I.C. & Balslev, H. (eds.) Tropical forests: Botanical Dynamics, Speciation and Diversity. Academic Press, London, pp. 35-45.